El 1 de setiembre del 2016 Escobar Amarilla fue condenado a 3 años de pena privativa de libertad, por procesamiento ilícito de desechos.
La sentencia fue dictada por el Tribunal presidido por Blanca Gorostiaga e integrado por Lourdes Peña y Manuel Aguirre, fue ratificada por el Tribunal de Apelación, 3ª sala en mayoría, en noviembre del 2018.
La fiscala Sara Torres, quien en su alegato final solicitó una condena de 5 años de cárcel para el extitular de Petropar, sostuvo que Escobar incumplió normas aprobadas en el Plan de Gestión Ambiental para la recepción, tratamiento y procesamiento de derivados de petróleo y expendio de combustibles en el 2012.
El principal elemento considerado por el Tribunal fue una inspección realizada en mayo del 2012, durante el cual la Fiscalía constató que los desechos de los hidrocarburos fueron descartados en forma irregular.