Uno de los atractivos es la visita guiada a la Central Hidroeléctrica Yacyretá y Aña Cuá, que incluye la Esclusa de Navegación, la nueva Central Aña Cuá, vista panorámica de las dunas vegetadas y lagunas de la Isla Yacyretá. Los recorridos están habilitados de 07:00 a 13:00, con previo agendamiento en el Centro de Recepción de Visitas y posterior salida en los ómnibus.
En la Villa Permanente de Ayolas también abre sus puertas el Museo Histórico y Ambiental, de 07:00 a 15:00. El acceso es por grupos, con una visita guiada gratuita.
Otro de los atractivos turísticos habilitado para los días santos es el Refugio Faunístico Atinguy, situado a 10 km del pórtico de acceso a Ayolas. El acceso estará abierto de 08:00 a 15:00, con visitas guiadas al sector de las jaulas de los animales determinadas en los siguientes horarios: 08:00, 09:00, 10:30 y 13:00. El traslado es en forma particular, con vehículos propios de los visitantes. En el lugar se prohíbe el ingreso con comestibles, bebidas alcohólicas, mascotas, escuchar música a alto volumen y acampar.
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La EBY también habilita las visitas a las Reservas Naturales, de 08:00 a 15:00, de Jueves Santo a Domingo de Pascua. En este orden, son tres las reservas habilitadas para todos aquellos turistas interesados, quienes deben llegar a los lugares con sus propios medios: la Reserva Natural “Guasu Puku”, situada a 25 km de Ayolas (Misiones) y a 40 km de San Cosme y Damián (Itapúa), sobre ruta asfaltada que une a ambas localidades. También la Reserva Natural “Aguapey”, a 5 km del casco urbano de San Cosme y Damián, Itapúa, y a 40 km de Ayolas, Misiones. Y la Reserva Natural “Chopi Sa´yju”, situada a 15 km de Coronel Bogado, sobre la ruta PY08, en el lugar denominado San Miguel Potrero.
A todos los visitantes que optan por las reservas naturales se les solicita contar con calzados y ropa cómoda, agua y repelente.