Para muchos, separar a Nelson Haedo Valdez y que éste siga por decisión propia, podía convertirse en un problema a corto plazo. Y lo fue. A días del inicio del campeonato y a menos de un mes para debutar en la Copa Libertadores de América, Leonel Álvarez se reunió con el departamento de fútbol de Cerro Porteño y renunció. Los directivos aceptaron la decisión del colombiano y a partir de ahora la prioridad es el reemplazante.

Álvarez llegó a poco del comienzo del Clausura 2017 y se fue como campeón, pero en el intermedio pasaron varias cosas: diferencias con el plantel, el sistema que no encajó con la calidad de jugadores y la historia propia del club, el vestuario picante en el entretiempo del clásico y la charla que, prácticamente, obligó al DT a modificar su manera de jugar después de la eliminación en Barranquilla. Dirigió 26 partidos entre el torneo local y la Sudamericana: ganó 16 (dos por Copa), empató 4 (1) y perdió 6 (1).