Esta determinación la tomó a consecuencia de las denuncias que se dieron con respecto a supuestas irregularidades en los trabajos llevados a cabo por la mencionada comisión.

Para realizar la intervención fue designado Ramón Rodríguez Galeano. Tras la llegada del interventor, quedó automáticamente desafectado del cargo el director Daniel Garay Palacios, quien se desempeñaba como director hasta la fecha. Garay estará apartado del cargo durante el tiempo que dure la intervención.

Según establece la resolución, el plazo de 90 días que presumiblemente durará la intervención puede extenderse de acuerdo a las necesidades que serán definidas por el interventor.

El Ministerio Público lleva adelante una investigación sobre presuntas irregularidades en la Comisión Nacional del Pilcomayo. La Unidad de Delitos Económicos y Anticorrupción verificó los trabajos que se realizan con fondos del Estado en la zona del Pilcomayo. El fiscal general del Estado incluso comprobó que las aguas no ingresan al canal paraguayo.