Roque Santa Cruz fue una de las figuras de Olimpia en la victoria ante Junior de Barranquilla por la Copa Libertadores de América: el delantero marcó de cabeza a los 37' para el 1-0 en el Defensores del Chaco. El goleador volvió a convertir en el certamen casi un año después: la última vez, fue ante Independiente del Valle, el 10 de febrero del 2017.
En aquella ocasión, recibió un centro desde la izquierda de Walter Bogado y definió con un cabezazo, frente al arco norte, para el 3-1 del Franjeado. El tanto le dio la clasificación al conjunto paraguayo a la Tercera Fase. Desde su vuelta en 2016, suma dos a nivel internacional y desde su debut, en 1999, lleva 4 (doblete a Cerro Porteño en aquella edición).