Djokovic, en plena forma, superó a Federer en el podio porque la estrella suiza, que defendía corona en Shanghai, fue apeado en semifinales por el croata Borna Coric -número 13 tras ganar 6 puestos-, al que luego el serbio batió en la final.
Nadal, que no ha anunciado una fecha para su regreso, cuenta con 7.660 puntos, solo 215 más que Djokovic, que podría competir en Viena o Basilea para superar lo antes posible al español.
Tras los tres grandes del último lustro, no se registró ningún cambio en el Top 10, aunque el argentino Juan Martín Del Potro, cuarto, se fracturó la rótula de la rodilla derecha en Shanghai, y se desconoce cuándo podrá volver a competir.
1. Rafael Nadal (ESP) 7660 pts
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2. Novak Djokovic (SRB) 7445 (+1)
3. Roger Federer (SUI) 6260 (-1)
4. Juan Martin Del Potro (ARG) 5860
5. Alexander Zverev (GER) 5025
6. Marin Cilic (CRO) 4185
7. Dominic Thiem (AUT) 3825
8. Kevin Anderson (RSA) 3775
9. Grigor Dimitrov (BUL) 3440
10. John Isner (USA) 3290