Por citar un caso, está el del exsenador Enzo Cardozo, acusado por el desvío de 3.700 millones de guaraníes del Ministerio de Agricultura y Ganadería, cuando se desempeñaba como ministro. Luego de cinco meses de haberse planteado una casación, recién la rechazó el 11 de febrero pasado. El caso está por cumplir cinco años y aún no se hace la preliminar.
Otra negligencia de dicha secretaría se dio en un caso de lavado de dinero, asociación criminal y comercialización de drogas, donde la Sala Penal habilitó por error a la fiscala Estefanía González. En agosto del 2018 la secretaria de la sala penal Karina Penoni, informó que no había ninguna impugnación pendiente de estudio en la Corte en dicha causa, por ello, la fiscala Estefanía González en setiembre del mismo año acusó y pidió juicio oral para Haron Jorge Hougham, argentino y Gloria Marilín Peralta de Maqueda, paraguaya. Sin embargo, el 9 de octubre la misma Sala Penal rechazó una impugnación en contra de González, con lo que se concluye que a la hora de acusar la agente estaba recusada. El juez Humberto Otazú consideró esto como una falta de acusación y remitió el caso a la Fiscalía General para que presente su requerimiento.