Policías torturadores y otros jefes de dependencias políticas fueron llevados a juicio y en muchos casos la justicia les alcanzó antes de la muerte, en otros caso la parca se adelantó a la diosa Astrea.
El Poder Judicial, sometido por 35 años bajo el yugo opresor de la dictadura, en 1989 comenzó a depurarse y cambiar su rumbo. Muchas condenas ordenadas por Stroessner quedaron anuladas, entre ellas, la más resaltante fue la del capitán de Caballería, Modesto Napoleón Ortigoza, quien estuvo preso desde 1962.
Las puertas de la justicia también quedaron abiertas para presentar denuncias y querellas contra torturadores y contra el mismo Alfredo Stroessner, quien para ese entonces ya estaba asilado en el Brasil.
Los abogados al servicio de los esbirros del régimen stronista comenzaron a buscar recursos y chicanas judiciales para evitar que sus clientes fueran a parar a la cárcel.
La prescripción de los delitos por los que fueron acusados muchos de los querellados fue la salida que consiguieron los letrados para evitar que los torturadores fueran procesados.
Sin embargo, en 1996 la Corte Suprema de Justicia resuelve en un fallo histórico que los delitos de lesa humanidad no prescriben y desde entonces cualquier persona que fue víctima de torturas durante la dictadura puede presentar una denuncia.
Alfredo Stroessner, nunca se sometió a la justicia, en base a un acuerdo se le dejó ir del país tras la caída de su régimen de terror y se refugió en Brasil, hasta su muerte. Sin embargo otros sostenes de la dictadura no pudieron escapar y afrontaron largos juicios.
A 25 años de la caída de la dictadura, siguen habiendo muchos desaparecidos y casos abiertos en la justicia esperando la sentencia.
Durante los años que duró el stronismo 128.077 personas fueron afectados en sus DD.HH, 18.772 víctimas de torturas, 377 desaparecidas, 59 fueron ejecutadas extrajudicialmente y 3.400 personas fueron exiliadas.
Hasta la fecha los casos por violación de DD.HH que ya tienen sentencia firme son:
CASO: Muerte de Mario Schaerer Prono
CONDENADOS
Pastor Coronel (25 años) (+)
Lucilo Benítez (25 años)
Juan Martínez (25 años)
Camilo Almada (25 años)
Gral. Britez Borges (5 años) (+)
Sabino A. Montanaro (+)
CASO: Muerte de Alberto Alegre Portillo
Pastor Coronel (8 años) (+)
Lucilo Benítez (8 años)
CASO: Ligas Agrarias
Pastor Coronel (25 años) (+)
Lucilo Benítez (25 años)
Agustín Belloto (12 años + 6 meses) (+)
CASO: Muerte de Amilcar Oviedo
Pastor Coronel (25 años) (+)
Lucilo Benítez (25 años)
Camilo Almada (12 años)
Sabino A. Montanaro (+)
CASO: Julián Cubas
Lucilo Benítez (12 años)
Camilo Almada (12 años)
CASO: Muerte de los hermanos Rodolfo y Benjamín Ramírez Villalba
Pastor Coronel (25 años) (+)
Juan Martínez (12 años + 6 meses)
Alberto Cantero (12 años + 6 meses) (+)
Lucilo Benítez (12 años + 6 meses)
Camilo Almada (12 años + 6 meses)
Agustín Belloto (12 años + 6 meses)
Sabino A. Montanaro (+)
CASO: Miguel Ángel Soler
Pastor Coronel (16 años + 6 meses)
Lucilo Benítez (16 años + 6 meses)
Juan Martínez (16 años + 6 meses)
Camilo Almada (16 años + 6 meses)
Sabino A. Montanaro (+)
CASO: Carlos Mancuello
Pastor Coronel (17 años) (+)
Lucilo Benítez (13 años + 9 meses)
Camilo Almada (13 años + 9 meses)
Alberto Cantero (7 años + 6 meses) (+)
Agustín Belloto (7 años + 6 meses) (+)
Sabino A. Montanaro (+)
CASO: Agustín Goiburu (En trámite en la Cámara de Apelación)
Francisco Ortiz Tellez (10 años)
Sabino A. Montanaro (+)