El técnico mexicano se impuso por última vez al equipo bilbaíno en septiembre de 2013, cuando en el banquillo del Espanyol venció por 3-2 en el inicio de la temporada 2013-2014.
Desde entonces, el actual preparador valencianista acumula un balance de una derrota y dos empates con un gol a favor y dos en contra.
La derrota la sufrió al frente del Leganés por la mínima (0-1) en la temporada 2018-2019 mientras que los empates se produjeron al frente del Real Mallorca: 1-1 en la campaña 2022-2023 y 0-0 en la 2023-2024.
Aguirre se estrenó en Primera división en 2002 al frente del Osasuna y desde entonces ha dirigido a un equipo de la máxima categoría del fútbol español en otras cinco ocasiones: Atlético de Madrid, Zaragoza, Espanyol, Leganés y Real Mallorca.
En este tiempo se ha medido a Athletic como local en 12 ocasiones con un balance de cuatro triunfos, tres empates y cinco derrotas con 16 goles a favor y 20 en contra.
Su primer duelo se produjo en 2003 al frente del Osasuna y se saldó con su peor goleada (1-5) mientras que sus victorias siempre han sido por la mínima.