Entonces, tras superar la eliminatoria de octavos de final contra el Nápoles, vivió el 14 de agosto de 2020 la mayor goleada en Europa del club catalán en la fase final que se disputó en Lisboa como consecuencia de las restricciones adoptadas por la pandemia del covid-19. Aquel fue su último partido antes de ser destituido y después de haberse hecho cargo del equipo, en el mes de enero, en sustitución del también destituido Ernesto Valverde.

Pese a su dilatada carrera como entrenador, en la que ha dirigido más de quinientos partidos en siete clubes, su experiencia europea se centra en los partidos con el Barcelona y a los dirigidos con el Betis.

Al frente del equipo andaluz disputó la Liga de Europa 2018-2019 y tras superar la primera fase, cayó en la eliminatoria de dieciseisavos frente al Stade de Rennes por un resultado global de 6-3.