Querétaro será el segundo equipo de primera división en la carrera de Mora. Entre 2022 y 2023 dirigió al Atas.
También condujo al Johor Darul Ta’zim JDT de Malasia, con el conquistó nueve títulos: cuatro ligas, cuatro supercopas y una copa.
Al Atlas lo dirigió durante 41 partidos con un balance de 13 victorias, 14 empates y 14 derrotas,
Querétaro terminó en el penúltimo puesto de la fase regular del torneo Apertura , Mora tendrá que hacerle frente a un equipo que fue penúltimo lugar el torneo pasado, que no tiene grandes figuras y uno de los presupuestos más bajos de México.
Mora debutará con su nuevo club en enero próximo, cuando comienza el Torneo Clausura.