La Junta departamental de Guairá, en dos ocasiones, rechazó la rendición de cuentas del Gobernador Juan Carlos Vera Báez, por falta de documentos respaldatorios, obras inconclusas y aparentemente sobrefacturadas, indicios de corrupción y otros, y en consecuencia presentaron una denuncia penal en contra del ejecutivo ya en agosto del 2021. Sin embargo, la denuncia duerme en las unidades anticorrupción del Ministerio Público.