En nuestro medio, Silva actuó por Libertad, las selecciones menores, en 3 de Febrero de Ciudad del Este y en el Independiente de Campo Grande.
En Ecuador, Francisco defendió los colores del Delfín de Manta, en el que tuvo su mejor desempeño, teniendo en cuenta que escasa continuidad en el Emelec de Guayaquil, con el que apenas disputó cuatro lances y señaló un tanto. Fuerza Amarilla es un club con sede en la ciudad de Machala, fundado el 23 de diciembre de 1999.