El certamen, que se realizará en dos zonas de 15 equipos cada una, tendrá un interzonal de emparejamientos de clásicos y el ordenamiento determinó que el superclásico se celebre en la decimoquinta y penúltima de la fase regular.
Los ocho mejores de cada zona se clasificarán a los octavos de final que, al igual que los cuartos de final y las semifinales, se jugarán a partido único con condición de local para el equipo de mejor campaña.
La final se jugará en campo neutral, tal como en las últimas cuatro temporadas.
En esta temporada, y luego de la suspensión de los descensos en 2024, dos equipos perderán la categoría a fin de año: uno por tabla general -donde se contabilizarán ambas fases regulares con un total de 32 equipos-, y el restante por la tabla de promedios, que contempla las últimas tres temporadas.
Tras la determinación de las zonas y fechas de la Copa Inicial de la Liga Profesional, se realizó también el sorteo de la Copa Argentina, que reúne equipos de todas las categorías, y tanto Boca Juniors como River Plate tendrán rivales de la cuarta categoría del fútbol local: Argentino de Monte Maíz y Kimberley de Mar del Plata, respectivamente.