Algunos virus, hongos y otros agentes dañinos pueden sobrevivir en el compost dado que la putrefacción no necesariamente acaba con ellos. Eso hace que se sigan extendiendo al año siguiente a través del compost. Es por eso que los restos de hojas afectadas por hongos, por ejemplo, no deberían acabar allí.

Tampoco deberían usarse para el compost los yuyos. Las plantas que se multiplican con semillas u otros yuyos de raíz también deberían ir a parar al cubo de basura.

Hay que tener en cuenta que al compost pueden ir no sólo restos de plantas sino también filtros de té y café y cáscaras de huevo. También pueden ir a parar al abono pequeñas cantidades de papel de diario, como por ejemplo el que envuelve a los huevos. Sin embargo, no hay que poner demasiado papel en el compost.

Los restos de verdura y fruta se pueden añadir al compost con moderación, sobre todo las que están tratadas con productos antihongos.