El siniestro que la afectó fue hace tres años. Entre los arreglos, se citan el cambio de la estructura del techo de todo el edificio, además de la colocación de los pisos que son antideslizantes. Asimismo, el techo que tiene ahora la TOA permitirá que se pueda instalar un mecanismo central de refrigeración y calefacción.
La empresa adjudicada que tiene a su cargo los trabajos de reparación parcial del edificio es la Constructora Engineering SA por G. 7.512.994.305. El director de la TOA, Jorge Peña, señaló que una de las modificaciones sustanciales que se tendrá con el nuevo diseño de la Terminal, es que las boleterías mirarán hacia adentro, así se conseguirá más espacio para los pasajeros.
Indicó que en las dársenas también se realizarán modificaciones para mejorar el lugar donde paran los vehículos de pasajero.
La TOA fue siniestrada el 3 de marzo del 2017, ocasión en que el incendio afectó el 25% de las instalaciones. Luego de esto, se iniciaron tareas legales y administrativas para la obtención de los fondos.