El Colonia, recién ascendido, se había adelantado en el minuto 29 por medio de Dominick Drexler, pero en la recta final de la segunda mitad el Dortmund protagonizó su gran remontada, con dianas del inglés Jadon Sancho (70), del marroquí Achraf Hakimi (87) y del español Paco Alcácer (90+4).
Para Alcácer es su tercer tanto en esta Bundesliga, después de los dos que había logrado el pasado fin de semana en el 5-1 sobre el Augsburgo.
Con ello queda provisionalmente en cabeza de la tabla de anotadores, ahora con un gol de ventaja sobre su compañero Jadon Sancho y sobre el polaco Robert Lewandowski (Bayern de Múnich), cuyo equipo jugará el sábado en el terreno del Schalke 04.
En la clasificación, el Dortmund tiene un pleno de 6 puntos, por lo que el Bayern, que empató 2-2 en la primera jornada contra el Hertha, se ve forzado a no fallar en Gelsenkirchen si no quiere quedar más descolgado en la tabla.
Al buen momento del Dortmund se suma la conquista a principios de este mes de la Supercopa de Alemania, derrotando 2-0 precisamente al Bayern.
El RB Leipzig, que acabó segundo de la clasificación la primera jornada, jugará el domingo en casa contra el Eintracht de Fráncfort.
Ganando por tres tantos de margen o más, el Leipzig se aseguraría desplazar del primer puesto al Dortmund por una mejor diferencia de goles.