Esta será la décima presencia de Nacional en el torneo más importante a nivel de clubes del continente donde en el 2014 supo llegar a la final ante el San Lorenzo de Argentina.
La academia ha jugado hasta el momento 50 partidos en la Libertadores y ha enfrentado a dos equios ecuatoriaos, el Aucas será el tercero. El primer equipo de Ecuador en el camino del equipo paraguayo fue El Nacional, en el 2009. El primer partido ganó la academia en Ecuador por 5-0 con dos goles de Jorge Núñez, y uno de Raúl Román, Ramón Cáceres y Marcos Melgarejo.
El segundo partido fue el juego de vuelta en Asunción que se saldó con un empate a tres goles con Jorge Núñez marcando dos goles más y uno Heber Arriola. En el 2019 el equipo rival de Nacional fue el Delfín Manta.
Los ecuatorianos ganaron el primer partido 3-0 y aquí en Asunción también triunfaron por 2-1. El único gol de Nacional lo anotó Juan Ignacio Vieyra.
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Nacional tiene 50 partidos jugados en la Libertadores, de los que ganó 12, empató 12 y perdió en 26 ocasiones. Tiene 57 goles a favor y 55 en contra, su áximo goleador en el torneo continental es Jorge Daniel Núñez con 7 goles.
Raúl Piris es el jugador que más veces vistió la tricolor en la Libertadores, 28 partidos, mientras que el técnico que más veces dirigio a Nacional en el torneo es Gustavo Morínigo, 15 juegos.