El Mundial júnior de natación se celebró por primera vez en 2006 en Río de Janeiro (BRA). Las ediciones posteriores del evento bienal siguieron en Monterrey (MEX) en 2008; Lima (PER) en 2011; Dubái (EAU) en 2013; Singapur (SGP) en 2015; Indianápolis (EEUU) en 2017; y Budapest (HUN) en 2019.
El evento, originalmente programado para realizarse en Kazan (RUS) en 2021, se pospuso para 2022 debido a cambios en el calendario deportivo internacional y la reprogramación de los Juegos Olímpicos de Tokio para el verano de 2021.
La FINA retiró el evento de Kazan tras la invasión de Rusia a Ucrania.