Al respecto, también consultamos con el titular del viceministerio de Transporte, del cual depende la Marina Mercante, Pedro Britos, quien indicó que entre las irregularidades encontradas se pueden señalar varios puntos. En cuanto a resoluciones de habilitaciones temporales de puertos, se detectó que la Dirección emitió resoluciones de habilitación de puertos que ya se encontraban con permisos fenecidos; además, el director de la Marina Mercante (Osvaldo López) firmó habilitaciones temporales de puertos sin estar autorizado para hacerlo. Tenía que poner todo a consideración del ministro de Obras Públicas, pero tal cosa nunca pasó.

También, en casos de fiscalizaciones, se comprobó que se emitían recibos de dinero con logo de la institución pero el producto de dicha recaudación nunca ingresó a la Marina Mercante.

La intervención de la Marina Mercante es por 90 días y está a cargo de la abogada Farah Estela Aguirre.