Cardozo está procesado por lavado de dinero, asociación criminal, tráfico y comercialización de estupefacientes a través de vuelos de la empresa San Jorge.

San Jorge fue creada el 29 de agosto del 2014 por Ulises Cardozo, David Esteban Martínez Navarro y Hadson Costa Dos Santos (prófugo). La Fiscalía antidrogas sostiene que trataría de una empresa de fachada, a fin de dar apariencia lícita con el objetivo real de realizar el tráfico de drogas.

Cardozo fue aprehendido en agosto del 2016 junto a otras personas, entre ellas exmilitar Enrique Sarubbi Flores (piloto), quien falleció en prisión.

Esta causa fue objeto de auditoría tras conocerse que en el 2018 Cardozo estuvo más de un mes en su casa en forma irregular, pues la legislación no permitía medidas en este tipo de casos. La Corte no informó aún el resultado de la auditoría.

En el 2017, Cardozo sufrió un atentado en la cárcel de Tacumbú, durante el cual recibió nueve estocadas, situación que motivó su internación en el Hospital Nacional de Coronel Oviedo.

Posteriormente, debió regresar a prisión pero fue enviado a su casa con una ambigua resolución de la jueza ejecución Lourdes Scura (suspendida por su actuación en otros casos).