El basalto, material duro que cubre el Acuífero Guaraní, presenta una forma de altibajos, donde la parte más profunda se encuentra en Brasil (1.600 metros por debajo del nivel del mar) y Argentina (1.200 m.), mientras que en Paraguay está a menos de 100 m. Además de esta facilidad de acceso, los estudios indican que el mencionado acuífero tiene su recarga natural en Brasil y su descarga en los humedales del Ñeembucú.