La mencionada dependencia tiene cuatro departamentos: el Operativo, Criminalístico, Químico Biológico y Técnico. En todos estos campos hay profesionales que están capacitados para operar la tecnología que se adquirió. En el laboratorio forense se estudian todas las evidencias que son recolectadas en las escenas donde se registró un crimen o algún otro delito. Los equipamientos pueden buscar huellas, muestras de ADN y otros rastros que hayan quedado en el lugar.

Los expertos del departamento técnico se organizan en turnos de 24 horas presenciales. Intervienen en la escena del crimen e investigan técnica y científicamente los hechos de muerte violenta, homicidio doloso y muerte súbita ocurridos en Asunción y Central. También el laboratorio cuenta con dos unidades móviles totalmente equipadas para el efecto.