En la época de la dictadura stronista (1954-1989) todos los ministros de Corte eran elegidos a dedo, por orden de Alfredo Stroessner que no necesitaba de acuerdo con otros partidos políticos y tampoco aprobación del parlamento. Cada integrante de la máxima instancia (en ese entonces eran solo cinco miembros) debía tener la “bendición” del dictador.
Con la caída del régimen totalitario en 1989, se vinieron muchos cambios, lentos, pero cambios al final. En 1992 la nueva Constitución Nacional, impuso un cambio en la Corte con respecto la cantidad de sus miembros, de cinco pasarían a ser nueve ministros. El método de elección también fue modificado.
Juan Carlos Wasmosy ganó las elecciones generales en 1993 por la ANR. La misión era hacer un recambio total en la Corte. Sin embargo una nueva escena política, desconocida hasta entonces, se avisoraba, la oposición tenía mayoría en el Congreso.
El PLRA, se había hecho fuerte y tenía una marcada presencia parlamentaria y hasta desplazaba a la “aplanadora” colorada si se sumaba al Encuentro Nacional, era el tiempo de sentarse a conversar negociar. De la mano de Domingo Laíno nace el “pacto de gobernabilidad”, que no era otra cosa que lo que ahora conocemos como cuoteo político. La ANR tomaría cierta porción de ministros en la Corte y el PLRA otra, se le iba a dar también a otros partidos políticos con representación parlamentaria una parte de la torta.
De esa manera en 1995 se integra la primera Corte Suprema de Justicia de la democracia con nueve ministros.
Cada presidente de la República,vino con su discurso de hacer que la justicia sea más eficaz, pero en realidad lo que siempre quisieron es crear una Corte a su medida y lo lograron en gran medida.
Después de Wasmosy, vino Raúl Cubas, quien estuvo apenas ocho meses en el poder, luego renunció en el tristemente celebre “marzo paraguayo”. Ahí asume Luis Ángel González Macchi, quien heredó los mismos ministros. Se dieron cambios por renuncias y fallecimientos. Durante estos años el PLRA perdió un escaño ya que un ministro fallecido fue reemplazado por un colorado .
Recién con la asunción de Nicanor Duarte Frutos, como presidente de la República, una vez más se movió el avispero dentro de la máxima instancia judicial. Duarte Frutos anunció que iba a “barrer” con la Corte Suprema y así lo hizo, ya sea por renuncia o juicio político seis ministros fueron cambiados.
Sin embargo, pese a los cambios, la ANR siguió manteniendo su supremacía numérica, hecho que se mantiene hasta hoy.
El gobierno de Horacio Cartes, tardó un poco más de un año, para iniciar los trámites del cuoteo político. Todo está encaminado para sacar de la Corte a cuatro ministros. Dos colorados y dos liberales, Víctor Núñez, Miguel Óscar Bajac, Sindulfo Blanco y César Garay Zucolillo, están a las puertas de un juicio político y por esa vía se planea hacer una renovación que podría con el tiempo afectar a más integrantes de esta instancia judicial. Los partidos tradicionales siguen manteniendo sus escaños en la máxima instancia judicial, aunque con un escenario un poco diferente en el que algunos ministros se nombraron inamovibles..